杭州城市学研究理事会成立于2009 年，是杭州城市学、杭州学研究的领导机构，负责研究工作的统一规划、统一组织、统一协调和统一执行。原中共浙江省委常委、杭州市委书记，杭州城市学研究理事会理事长，浙江省首批新型重点专业智库浙江省城市治理研究中心主任、首席专家，浙江大学兼职教授、兼职博士生导师，中央美术学院客座教授、客座博士生导师，浙江省大运河文化保护传承利用暨国家文化公园建设工作专家咨询委员会主任王国平担任理事会理事长，杭州市有关领导、高校领导、知名专家学者担任副理事长，邀请城市领域专家学者、城市管理者、城市学战略合作单位负责人担任理事。理事会每年举行全体会议或理事会议，研究部署城市学研究工作的重大事项。理事会秘书处设在杭州城研中心，负责相关沟通联络和日常工作。